Die funktionelle Neurochirurgie ist ein spezialisierter Bereich der Neurochirurgie, der sich auf die Behandlung neurologischer und psychiatrischer Erkrankungen durch gezielte chirurgische Eingriffe am Gehirn konzentriert. Ziel ist es dabei, die Funktion bestimmter neuronaler Netzwerke zu verändern, um Symptome zu lindern oder Funktionen zu verbessern.
Seit Jahren besteht in der Klinik und Poliklinik für Neurochirurgie eine enge Zusammenarbeit mit den neurologischen und psychiatrischen Universitätskliniken im Bezirksklinikum Regensburg zur Therapie von Patienten mit Bewegungsstörungen und psychiatrischen Erkrankungen: Zentrum für Tiefe Hirnstimulation.